I forbindelse med dannelsen af DUEN er der sammensat en bestyrelse i henhold til Vedtægter for Det danske Ungdomsensemble. Den består af fem personer, som er udpeget såvel inden for som uden for musiklivet:
Peter Huusom – Head of Culture and Leadership, formand for DUENs bestyrelse
Jens Dammeyer Sørensen – Musikskoleleder, Holstebro Musikskole
Claus Skjold Larsen – Rektor for Syddansk Musikkonservatorium
Frank Birkebæk – Tidl. chef for Roskilde Museum og medlem af Kulturministeriets visionsgruppe
Louise Brincker – Chefkonsulent i Udenrigsministeriet
Bestyrelsen repræsenterer centrale interessenter og samarbejdspartnere i og uden for musiklivet og det er dens opgave, sammen med den kunstneriske leder, at understøtte og udvikle ensemblets platform som talentudviklingsforum og klassisk musikformidler.